Bestuur & Structuur
Als vzw heeft MilkBE een bestuursorgaan en hierboven staat uiteraard de algemene vergadering. Maar om een optimale werking van MilkBE te kunnen faciliteren, werd er een uitgebreide structurele kapstok uitgewerkt. Telkens waar de interesses van de verschillende ketenpartijen en partners samenkomen, wordt een domein gedefinieerd waaraan een werkgroep of commissie wordt gekoppeld. Een commissie heeft meer autonomie dan een werkgroep en kan een eigen budget beheren en eigen reserves opbouwen.

Algemene vergadering
Binnen de vereniging wordt steeds een pariteit voorzien tussen de leden uit de groep van de producenten en leden uit de groep van de melkverwerkers. De vereniging bestaat ten minste uit 16 leden zijnde:
- 5 leden uit de groep van de vertegenwoordigers van de producenten:
- 1 persoon op voordracht van Algemeen Boerensyndicaat vzw,
- 2 personen op voordracht van Boerenbond vzw,
- 2 personen op voordracht van FWA Etudes-Information asbl.
- 5 leden uit de groep van de vertegenwoordigers van de melkverwerkers, op voordracht van BCZ-CBL vzw.
De voorzitter wordt voorgedragen door de producenten en de eerste ondervoorzitter door de melkverwerkers. De tweede ondervoorzitter wordt voorgedragen door de producenten, maar komt bij voorkeur van de andere kant van de taalgrens dan de voorzitter.
Bestuursorgaan
Het bestuursorgaan bestaat uit minstens 10 bestuurders. In het bestuursorgaan is er pariteit tussen de bestuurders voorgedragen door de groep van de producenten en de bestuurders voorgedragen door de groep van de melkverwerkers. Beide groepen hebben elk 5 bestuurders. Zetelen in het bestuursorgaan:
- Dhr. Dirk Van De Keere, voorzitter (Boerenbond)
- Dhr. Renaat Debergh, eerste ondervoorzitter (BCZ-CBL)
- Dhr. Marc Decoster, tweede ondervoorzitter (FWA)
- Jos Borghans (BCZ-CBL)
- Michèle Lambrechts (BCZ-CBL)
- Koen Lowagie (BCZ-CBL)
- André Ledur (FWA)
- Tom Schiettecat (BCZ-CBL)
- Roel Vaes (Boerenbond
- Hendrik Van den Haute (ABS)
Statuten
De statuten gelden als de "grondwet" van MilkBE en werden neergelegd bij de griffie van de ondernemingsrechtbank van koophandel en bekendgemaakt in het Belgisch Staatsblad. Ze beschrijven onder andere de doelstellingen van MilkBE, de rechten en plichten van de leden en het bestuursorgaan en de procedure bij eventuele geschillen.
Een wijziging van de statuten moet steeds worden goedgekeurd door de Algemene vergadering.