Bestuur & Structuur
Als vzw heeft MilkBE een bestuursorgaan en hierboven staat uiteraard de algemene vergadering. Maar om een optimale werking van MilkBE te kunnen faciliteren, werd er een uitgebreide structurele kapstok uitgewerkt. Telkens waar de interesses van de verschillende ketenpartijen en partners samenkomen, wordt een domein gedefinieerd waaraan een werkgroep of commissie wordt gekoppeld. Een commissie heeft meer autonomie dan een werkgroep en kan een eigen budget beheren en eigen reserves opbouwen.

Algemene vergadering
Binnen de vereniging wordt steeds een pariteit voorzien tussen de leden uit de groep van de producenten en leden uit de groep van de melkverwerkers. De vereniging bestaat ten minste uit 16 leden zijnde:
- 8 leden uit de groep van de vertegenwoordigers van de producenten:
- 2 persoon op voordracht van Algemeen Boerensyndicaat vzw,
- 3 personen op voordracht van Boerenbond vzw,
- 3 personen op voordracht van FWA Etudes-Information asbl.
- 8 leden uit de groep van de vertegenwoordigers van de melkverwerkers, op voordracht van BCZ-CBL vzw.
De voorzitter wordt voorgedragen door de producenten en de eerste ondervoorzitter door de melkverwerkers. De tweede ondervoorzitter wordt eveneens voorgedragen door de producenten, maar komt bij voorkeur van de andere kant van de taalgrens dan de voorzitter.
Bestuursorgaan
Het bestuursorgaan bestaat uit minstens 10 bestuurders. In het bestuursorgaan is er pariteit tussen de bestuurders voorgedragen door de groep van de producenten en de bestuurders voorgedragen door de groep van de melkverwerkers. Beide groepen hebben elk 5 bestuurders. Zetelen in het bestuursorgaan:
- Dhr. Dirk Van De Keere, voorzitter (Boerenbond)
- Dhr. Renaat Debergh, eerste ondervoorzitter (BCZ-CBL)
- Dhr. Marc Decoster, tweede ondervoorzitter (FWA)
- Michèle Lambrechts (BCZ-CBL)
- Ingeborg Van Wonterghem (BCZ-CBL)
- Koen Lowagie (BCZ-CBL)
- André Ledur (FWA)
- Roel Vaes (Boerenbond)
- Hendrik Van den Haute (ABS)
- Paul Vanhengel (BCZ-CBL)
Statuten
De statuten gelden als de "grondwet" van MilkBE en werden neergelegd bij de griffie van de ondernemingsrechtbank van koophandel en bekendgemaakt in het Belgisch Staatsblad. Ze beschrijven onder andere de doelstellingen van MilkBE, de rechten en plichten van de leden en het bestuursorgaan en de procedure bij eventuele geschillen.
Een wijziging van de statuten moet steeds worden goedgekeurd door de Algemene vergadering.
Reglement van orde
In het reglement van orde zitten de interne voorschriften voor de werking van MilkBE vervat. Zo komt de interne structuur van MilkBE, met haar werkgroepen en commissies aan bod en wordt er uitgelegd wat het partnerschap juist inhoudt. Ook de taken van de voorzitter, de ondervoorzitters en het secretariaat worden hierin opgelijst, evenals de rol van waarnemers en externe experten binnen de werking van MilkBE. Passages over mededinging, belangenbermenging, privacy en vertrouwelijkheid vinden eveneens hun plaats in het reglement van orde.
Leden van MilkBE onderschrijven automatisch het reglement van orde. De inhoud van het reglement van orde wordt bepaald door het bestuursorgaan.
De commissies Botulisme en IDF BENC hebben daarnaast elk een eigen intern reglement, gezien hun hogere graad van autonomie. Ook deze reglementen kunnen leden via onderstaande knoppen raadplegen.
